2002年5月9日成立阿里地区建设局，2010年5月11日更名阿里地区住房和城乡建设局。2016年12月22日成立阿里地区人民防空办公室，与阿里地区住房和城乡建设局一套班子两个牌子，机构名称为阿里地区住房和城乡建设局（阿里地区人民防空办公室）。局机关内设4个科室，分别为办公室、住房保障和房地产业科（公积金监督管理科 住房制度改革办公室）、城乡建设规划科、建筑市场监管科（工程质量监督管理科）。参照公务员法管理事业单位4个，分别为阿里地区住房资金管理中心、阿里地区建设工程质量安全监督站、阿里地区建设工程造价管理中心（招投标管理中心）、阿里地区城乡建设重点项目管理中心。事业单位2个，分别为阿里地区给排水管理所、阿里地区狮泉河镇污水处理中心。